Gruppenleiterin

Dr. Aleksandra  Skirycz
Dr. Aleksandra Skirycz
Group Leader
Telefon:+49 331 567-8216

Department Willmitzer

Kleine Signalmoleküle

Das Ziel der Arbeitsgruppe von Dr. Aleksandra Skirycz ist es neue kleine regulatorische und Signalmoleküle zu identifizieren und deren Funktion zu beschreiben. Hierfür werden Protein-Metabolit-Interaktionen studiert.

Die Gruppe wagt sich auf Neuland in der Interkationsforschung zwischen Proteinen und kleinen Molekülen und nutzt dabei neue und klassische Methoden.

Ackerschmalwand, Tabak und Hefe werden genutzt, um Netzwerke der Protein-Metabolit-Interaktionen und Ligand-Rezeptor-Paarungen zu identifizieren. <br /><br /><span>[Yeast photo was reproduced from WIKIPEDIA (taken by Mogana Das Murtey and Patchamuthu Ramasamy)]</span> Bild vergrößern
Ackerschmalwand, Tabak und Hefe werden genutzt, um Netzwerke der Protein-Metabolit-Interaktionen und Ligand-Rezeptor-Paarungen zu identifizieren. 

[Yeast photo was reproduced from WIKIPEDIA (taken by Mogana Das Murtey and Patchamuthu Ramasamy)] [weniger]

Die für die Gruppe interessantesten Interaktionen finden zwischen Ligand und Rezeptor statt, also den Auslösern von Signalwegen. Während zahlreiche kleine Moleküle mit Signalfunktion bekannt sind, fehlen meist noch Informationen über die passenden Rezeptoren. Aber auch umgekehrt fehlen häufig die Informationen über die kleinen Signalmoleküle zu einem bekannten Protein, dass diese binden kann. Die Kernaufgabe der Arbeitsgruppe liegt daran, diese Partner zu identifizieren.

Team

Dr. Aleksandra Skirycz (Group Leader)

Dr. Monika Kosmacz (Post-Doc)

Dr. Ewelina Sokolowska (Post-Doc)

Dr. Juan Camilo Moreno Beltran (Post-Doc)

Dr. Michal Gorka (Post-Doc)

Izabela Kasprzyk (PhD)

Marcin Luzarowski (PhD)

 

Methodenspektrum

•  Metabolomics

•  Proteomics

•  Größenausschlusschromatographie (SEC)

•  Affinitätschromatographie

•  Tandem-Affinitätschromatographie

•  CETSA/Thermisches Proteome-Profiling 

•  Micro-scale Thermophorese

 

Publikationen

Kosmacz, M.; Luzarowski, M.; Kerber, O.; Leniak, E.; Gutierrez-Beltran, E.; Moreno, J.C.; Gorka, M.; Szlachetko, J.; Veyel, D.; Graf, A. et al. (2018): Interaction of 2 ',3 '-cAMP with Rbp47b Plays a Role in Stress Granule Formation. Plant Physiology 177 (1), pp. 411 - 421 https://doi.org/10.1104/pp.18.00285

Luzarowski, M.; Kosmacz, M.; Sokolowska, E.; Jasinska, W.; Willmitzer, L.; Veyel, D.; Skirycz, A. (2017):Affinity purification with metabolomic and proteomic analysis unravels diverse roles of nucleoside diphosphate kinases. Journal of Experimental Botany 68 (13), pp. 3487 - 3499 https://doi.org/10.1093/jxb/erx183

Veyel D, Kierszniowska S, Kosmacz M, Sokolowska EM, Michaelis A, Luzarowski M, Szlachetko J, Willmitzer L, Skirycz A. (2017) System-wide detection of protein-small molecule complexes suggests extensive metabolite regulation in plants. Sci Rep. 7:42387. https://doi.org/10.1038/srep42387

Skirycz A, Kierszniowska S, Méret M, Willmitzer L, Tzotzos G. (2016) Medicinal Bioprospecting of the Amazon Rainforest: A Modern Eldorado?  Trends Biotechnol. 34:781-90. https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2016.03.006

 

 
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